监控系统追踪医院中的COVID感染热点 曼彻斯特大学团队应用新技术来检测和追踪医院内COVID-19的传播。这个概念验证系统结合了员工和患者的活动和互动，以及病毒的基因组测序，有助于指明如何最好地改善患者路径、员工活动和降低风险。他们发现了医院内患者和员工可能接触的热点，并分享了与引起COVID-19的病毒SARS-CoV-2相似或相同的变体。这项研究由曼彻斯特科学家、临床人员和医院管理层的独特合作推动，其结果发表在Elife期刊上。这项工作横跨了英格兰西北部的五家医院，可能对感染控制产生重要影响。该团队对从173名医护工作者和患者采集的喉咙和鼻拭子中的病毒进行了基因组测序。病毒，就像所有生物体一样，会随着时间累积小的基因变化，这些变化通常完全中性，不给病毒带来任何额外的优势。曼彻斯特团队利用病毒的自然基因变化来理解不同员工和患者间病毒样本有多密切相关。如果某个受影响个体的COVID-19基因组几乎与另一个相同，这表明它们共享一个共同的近源感染。将这些信息与患者和员工活动数据结合起来，可以确定感染集群发生的地点和时间。虽然使用基因组测序识别COVID-19变异需要至少一周的时间，但团队对这一过程能够在48小时内完成充满信心。因此，这种方法有望快速扩展。曼彻斯特大学的Jamie Ellingford博士说：“本研究中应用的方法完全揭示了每个样本中病毒的外观，超越了常规测试策略。这有助于识别发生暴发的医院区域，并帮助警示感染控制团队。”这种方法的潜在局限性是，在任何给定时间点，两个人可能仅仅由于偶然而非因为相关感染而分享相似的变异。为了克服这一点，团队对来自急诊科和30多个医院收集的人群中的病毒进行了测序。利用在相似时间点收集的更广泛的数据，他们可以确定共享病毒更为相似的个体集群。Ellingford博士说：“如果我们要减少和预防医院中的SARS-CoV-2传播，就必须了解感染控制方法的有效性。”Black教授表示：“一旦医院确定了集群，就可以采取一系列措施确保安全。用这些信息，医院管理者可以评估现有的感染控制实践，并轻松查明哪些方法最为有效。个人防护装备的使用也可以根据集群的位置进行调整。我们建议这些数据支持广泛采用筛查策略，以识别那些可能是SARS-CoV-2潜在感染者的医护人员，他们可能是SARS-CoV-2暴发的重要贡献者。我认为，发展更精确跟踪移动路径的方法在医院中可能非常有用，以扩展个体间的接触关系的特征，并了解该研究所强调的假设的准确性。”
